本劇場(chǎng)版分兩部分，實(shí)際上是替換95原版番劇的最后兩集，劇情接續(xù)原版第24集的結(jié)尾。原版最后兩集完全架空劇情，純粹秀了一場(chǎng)有關(guān)人物內(nèi)心世界的哲學(xué)探討，而替換后的劇場(chǎng)版加強(qiáng)了劇情方面的陳述，并拓寬了哲學(xué)思辨層面的深度和廣度。在第一部分《Air》中，明日香成功走出哀大莫過(guò)于心死的漫長(zhǎng)心結(jié)，終于發(fā)揮出最強(qiáng)實(shí)力，而碇真嗣的性格則向自閉自責(zé)的深淵一路滑落，永無(wú)止境，令人納罕。第二部分《真心為你》將科學(xué)和哲學(xué)有機(jī)融合起來(lái)，二者擁有一脈相承的幻想基因，劇情晦澀。在不斷強(qiáng)調(diào)個(gè)人心之壁壘和EVA的A·T力場(chǎng)的對(duì)等隱喻之時(shí)，劇場(chǎng)版追加了對(duì)生存現(xiàn)實(shí)、性幻想和生命起源等問(wèn)題的思索，在表現(xiàn)形式上更加恣意隨性，大量運(yùn)用文藝片意識(shí)流的鏡頭手法，甚至直接插入真人畫(huà)面。如果說(shuō)原版結(jié)局是回歸生活，那么劇場(chǎng)版的結(jié)局則是邁向新生。